前期選抜は、一部の普通科と専門学科・総合学科のほとんどで実施します。一部の高校・学科・コースで入学定員の100％を募集、実施する高校・学科・コースは事前に「選抜において重視する要件」を発表します。選考は、自己推薦書、調査書(内申書)と、各高校・学科が実施する検査(面接または自己表現、作文または小論文、実技検査、学力検査または総合問題などから1つ以上を各高校が指定)を総合した成績で行います。
スポーツ特別枠選抜は、前期選抜と同じ日程で、一部の高校・学科が競技を指定して実施します。募集人数は高校・学科、募集競技によって異なりますが、1競技につき数名となります。選考は、調査書(内申書)、スポーツ特別枠自己推薦書、実技検査の結果と、学力検査・面接・作文(実施する場合)などを総合した成績で行います。
※桑名高校・衛生看護科、四日市四郷高校・普通科(スポーツ科学コース)、飯野高校・応用デザイン科、白子高校・普通科(文化教養(吹奏楽)コース)、稲生高校・体育科、松阪工業高校・繊維デザイン科、相可高校・食物調理科、昴学園高校・総合学科は、2025年度(令和7年度)の前期選抜で入学定員の100％を募集し、原則後期選抜は行いません。

後期選抜は、前期選抜で入学定員の100％を募集する学科・コースを除く、すべての高校・学科で実施します。全員に5教科の学力検査を課し、高校・学科・コースによっては、面接または自己表現、作文または小論文、実技検査などを実施します。傾斜配点を行う高校・学科・コースもあります。選考は3段階で行われ、第1段階では、調査書(内申書)により選考された者のうち、学力検査と実技検査の得点合計が高い順に募集定員の約80％が合格。第2段階では、第1段階で調査書(内申書)により選考された者のうち、学力検査などの得点合計が高い順に、第1段階の合格者の人数と募集定員の差の1/2に当たる者が合格。第3段階では、各高校・学科・コースが示す「特に重視する選抜資料等」を踏まえて残りの合格者を決定します。

普通科と理数科には通学区域があり、北部学区・中部学区・南部学区の3学区に分かれていますが、隣接している学区の高校も出願可能です。
その他の専門学科、総合学科、普通科スポーツ科学コースと松阪高校理数科、「スポーツ特別枠選抜」は、県内全域から出願できます。